Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms