Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF31Q8WWY3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF31Q8WWY3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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