Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FNDC9Q8TBE3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC9Q8TBE3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms