Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME8Q8N427 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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