Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVBPQ8N300 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms