Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC83Q8IWF9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC83Q8IWF9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms