Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB11FIP4Q86YS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB11FIP4Q86YS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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