Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NLRX1Q86UT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRX1Q86UT6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms