Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACNA2D4Q7Z3S7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACNA2D4Q7Z3S7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms