Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUFY3Q7L099 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY3Q7L099 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms