Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMBR1LQ6UX01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMBR1LQ6UX01 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms