Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L2Q6R6M4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP17L2Q6R6M4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms