Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN1Q6NZI2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms