Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA1Q5VX52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms