Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF3Q5VWG9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms