Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDZK1Q5T2W1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDZK1Q5T2W1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms