Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HP1BP3Q5SSJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HP1BP3Q5SSJ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms