Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP188Q5SRE5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP188Q5SRE5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms