Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAN3Q58A45 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAN3Q58A45 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms