Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP13-3Q3SY46 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms