Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TWISTNBQ3B726 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms