Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRFIP1Q32MZ4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRFIP1Q32MZ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms