Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q1T7F1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q1T7F1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q1T7F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q1T7F1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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