Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DDR2Q16832 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms