Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPROQ16827 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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