Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKIV2LQ15477 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms