Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PUM3Q15397 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PUM3Q15397 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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