Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMD6Q15008 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMD6Q15008 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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