Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMC1AQ14683 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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