Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF1Q14162 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF1Q14162 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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