Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDE1CQ14123 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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