Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
CDK13Q14004 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
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