Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCIRG1Q13488 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCIRG1Q13488 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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