Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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SNTA1Q13424 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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