Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P3Q13401 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P3Q13401 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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