Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATMQ13315 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATMQ13315 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATMQ13315 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATMQ13315 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATMQ13315 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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