Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRDNQ13061 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRDNQ13061 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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