Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXF2Q12947 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXF2Q12947 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms