Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFIAQ12857 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
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