Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFCP2Q12800 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms