Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
HMGXB3Q12766 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
HMGXB3Q12766 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
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