Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACSM1Q08AH1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACSM1Q08AH1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms