Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4DQ08499 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE4DQ08499 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms