Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABPAQ06546 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms