Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SRSF11Q05519 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms