Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CENPCQ03188 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CENPCQ03188 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms