Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPL6Q02878 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPL6Q02878 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms