Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OC90Q02509 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OC90Q02509 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms