Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFITM3Q01628 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms