Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKL1Q00532 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms